Human Reference Atlas oluşturulması için AI destekli fonksiyonel doku birimi özelliklerinin çıkarılması
· FikirPilot
Communications Biology’de kabul edilmiş erken sürümü yayımlanan araştırma, İnsan Referans Atlası’nın (HRA) işlevsel doku birimlerine ilişkin özellikleri bilimsel yayınlardan otomatik çıkarmak için HRAftu-LM-RAG adlı yapay zekâ çerçevesini tanıttı. Anlaşılan, hRA, 25’ten fazla uluslararası…
Communications Biology’de kabul edilmiş erken sürümü yayımlanan araştırma, İnsan Referans Atlası’nın (HRA) işlevsel doku birimlerine ilişkin özellikleri bilimsel yayınlardan otomatik çıkarmak için HRAftu-LM-RAG adlı yapay zekâ çerçevesini tanıttı. HRA, 25’ten fazla uluslararası konsorsiyumun uzmanlarını bir araya getirerek insan vücudunun organ sistemlerinden tek hücre düzeyine uzanan çok ölçekli yapısını haritalamayı amaçlıyor. Uzmanlar şimdiye kadar 10 organdaki işlevsel doku birimlerini ayrıntılandırarak 2D çizimler hazırladı.
Doğrulanan sistem; metinsel akıl yürütme için Büyük Dil Modellerini, görsel yorumlama için Büyük Görüntü Modellerini. Doğrulanan sistem; metinsel akıl yürütme için Büyük Dil Modellerini, görsel yorumlama için Büyük Görüntü Modellerini ve bilgiyi kaynaklara dayandırmak için Retrieval Augmented Generation yöntemini birleştiriyor. Çalışmada 22 işlevsel doku birimiyle ilgili, 1,389,168 şekil içeren 244,640 PubMed Central yayını tarandı. Bunların arasından mikroskopi ve şematik görüntüler barındıran 617,237 şekil belirlendi. Görseller ve bağlantılı metinlerden 331,189 ölçek çubuğu, 1,719,138 biyolojik varlık ifadesi ile cinsiyet ve yaş gibi donör bilgileri otomatik çıkarıldı. Elde edilen verilerin, HRA kapsamındaki gelecekteki doku birimi çizimlerinin tasarlanması, incelenmesi ve onaylanmasını desteklemesi hedefleniyor.
HRA; HuBMAP, SenNet, KPMP, GUDMAP ve NIDDK tarafından, HRA Editorial Board ve 20’den fazla başka konsorsiyumun uzmanlarıyla geliştiriliyor. Yazarlar çıkar çatışması bildirmedi; destekçilerin araştırma ve yayın süreçlerinde rol almadığı belirtildi.